Последипломное обучение на кафедре проводится на основе разработанных коллективом кафедры и утвержденных Министерством здравоохранения унифицированных программ. Программа “Унифицированная программа последипломного обучения врачей по гастроэнтерологии”. состоит из 12 отдельных курсов, в каждом курсе от 5 до 15 разделов в зависимости от характера курса. В программу входит 12 циклов отдельных тематических усовершенствований.

Программа . “УНИФИЦИРОВАННАЯ ПРОГРАММА ПОСЛЕДИПЛОМНОГО ОБУЧЕНИЯ ПО ДИЕТОЛОГИИ” состоит из 11 отдельных курсов, в каждом от 5 до 12 разделов в зависимости от характера курса. В программу входит 5 циклов отдельных тематических усовершенствований .

С 1999г на кафедре в процессе обучения используются интенсивные методы и технологии обучения с использованием компьютерных мультимедийных презентаций, тестовых и ситуационных задач.

Кафедра активно проводит последипломное обучение в виде организации и проведения клинических конференций, семинаров различного уровня, от больничных до республиканских.

Еще одной формой обучения на кафедре является клиническая ординатура. К 2001г на кафедре в клинической ординатуре прошли обучение 11 врачей, из которых 6 специалистов - врачи из дальнего зарубежья.

На кафедре проводятся новые циклы тематического усовершенствования: “Основы клинического менеджмента гастроэнтерологических заболеваний”, “Актуальные вопросы гепатологии”, “Гастроэнтерологические аспекты абдоминальной сонографии”, “Физиология и патология системы органов пищеварения с основами нутрициологии”.

С 2001 г кафедра начала интенсивную разработку вопросов обучения по питанию и, прежде всего по здоровому питанию, направленному на профилактику заболеваний.